Покажите страницу «Общие настройки хранилищ файлов». С настройками кеша не баловались?
Покажите страницу «Настройки хранилища файловой системы». Галки для администратора отмечены?
Покажите страницу «Настройки хранилища файловой системы». Галки для администратора отмечены?
Права/владелец на каталоги repository и вложенные выставлены?