Hola, Patria
Sigo sin poder ver tus archivos de ejemplo, creo que no los estás adjuntando correctamente a tu mensaje. Usa el icono "Agregar" que se encuentra al lado de "Archivo adjunto", debajo de la caja de texto donde escribas tu mensaje (es lo que voy a hacer para anexarte un archivo .csv con un ejemplo).
En el archivo "Lista de usuarios para subir a Moodle.csv" que anexo a este mensaje, verás lo siguiente si lo abres con Excel, o con otro programa de hoja de cálculo:
Allí puedes ver ocho usuarios con los campos lastname, firstname, email y username (los campos mínimos que necesitas para subir a Moodle). Si dichos usuarios no existen en la plataforma serán creados con esos datos. Están también los campos city y country, y los que corresponden a los cursos en los que serán matriculados: course1, type1, course2, type2. Como ves los primeros cuatro usuarios serán matriculados en el curso nombre-corto-de-curso-1 solamente, mientras que los siguientes cuatro lo serán también ennombre-corto-de-curso-2. No hay problema en que course2 y type2 queden en blanco para los cuatro primeros.
Dependiendo de la configuración de tu sistema en cuanto a los "separadores de lista" puede que al abrir este archivo en un editor de texto plano (uso Notepad++) veas comas, o puntos y comas entre los diferentes valores:
En mi caso el separador es ";" como puedes ver. Usa este archivo como prueba cambiando los valores por los que necesites.
Para más información, busca aquí la que corresponda a tu versión de Moodle (creo que no la dices en tus mensajes): Subir usuarios - MoodleDocs.