Поправлюсь. Пропустил про размер в 38 гб. Для репозитория с програмным кодом этот размер невообразимо большой, значит туда попадают и ваши файлы из moodledata. Возможно админ настроил таким образом что-то вроде бэкапа, чтобы иметь возможность откатываться к состоянию на определенный момент времени. Но для этого обязательно нужен запуск по расписанию команды, которая бы добавляла в репозиторий изменения.
Зайдите в консоли сервера в папку, в которой находится папка .git, выполните
git --no-pager log -n 30
скиньте сюда, попробуем по описанию понять, что там в репозитории
нужно во всех cron поискать какую-то регулярную команду, содержащую или git, или какой-то скрипт, внутри которого есть вызов git, который пополняет репозиторий. Возможно, что этот скрипт делает ещё что-то, что предполагал тот, кто это настривал, и просто удалив папку с репозиторием вы можете создать больше проблем. Например, если там вместе с файлами бэкапится БД, то стоит разобраться, ведь эти бэкапы тоже будет занимать место на диске
Зайдите в консоли сервера в папку, в которой находится папка .git, выполните
git --no-pager log -n 30
скиньте сюда, попробуем по описанию понять, что там в репозитории
нужно во всех cron поискать какую-то регулярную команду, содержащую или git, или какой-то скрипт, внутри которого есть вызов git, который пополняет репозиторий. Возможно, что этот скрипт делает ещё что-то, что предполагал тот, кто это настривал, и просто удалив папку с репозиторием вы можете создать больше проблем. Например, если там вместе с файлами бэкапится БД, то стоит разобраться, ведь эти бэкапы тоже будет занимать место на диске