а смысл? в базе разные темы? отсортируйте по темам и сформируйте один тест со ссылкой на категории.

Сколько вопросов задавать - вам виднее. Если я вам скажу, что не 50, а 49 или 52, например, то разве вы меня послушаете? 
Единственное, что я могу утверждать наверняка, это то, что иметь 1300 вопросов в ОДНОЙ категории - это очень плохо. Случайный выбор вопросов должен осуществляться так, чтобы они РАВНОМЕРНО покрывали все темы и были примерно одинаковыми по сложности. Для этого вашу единственную пока категорию нужно разделить на множество категорий (подкатегорий) по темам и по сложности. Делается это очень просто. Банк вопросов имеет специальные инструменты для перемещения вопросов из одной категории в другую. Потом сделаете новый тест, указав в нем сколько вопросов из какой категории нужно взять.