обновление для moodle довольно просто реализуется. делаете бекапы файловых дирректорий (moodledata, www), дамп базы данных. все это в режиме техобслуживания. качаете нужную версию и кидаете в папку где лежит старый сайт, папку старого сайта предварительно переименовываете. из папки старого сайта копируете config.php с заменой. обновляетесь обновив страницу сайта. может занять до 30 минут в зависимости от объемов базы. возможно предварительно нужно будет скопировать и папки с плагинами если таковые в системе имеются.