Если проблемый только 1 курс, то есть смысл его удалить.
Если в проблемном курсе используется другая тема, то можно попробовать сменить тему.
Тот кто ставил этот moodle еще доступен? Попробуйте обратиться к нему.
Есть ли резервные копии moodle которые были сделаны до появления проблемы (или до ваших изменений оформления) ?
Но лучше найдите специалиста который поможет исправить проблему.