Hola, Daniel.
Creo que lo que quieres hacer no requiere de ningún plugin. Ya lo hace el propio sistema.
Por ejemplo, dejo una captura de pantalla marcando en rojo la opción que hay que elegir para mostrar un archivo PDF en un recurso "Archivo" mediante una ventana emergente o pop-up que creo es a lo que te refieres.
Para el caso de vídeos también se haría mediante un recurso "Archivo". Lo he probado con recursos tipo "Página" y "URL", y también funcionan.
El tema del ejemplo es Academi sobre Moodle 3.5, donde dicho tema para esta versión de Moodle está basado en Bootstrap, según la documentación.
Un saludo.
JP