Hola, Miguel.
Primero debes valorar si es opción para ti hacer una instalación limpia (nueva) y volver a cargar todo lo que tienes o es preferible actualizar. Para actualizar, dependiendo de la versión original que tengas funcionando, habrás de instalar primero versiones anteriores antes de llegar a la que quieres.
En otros casos, es posible una actualización directa. Aquí tienes la documentación acerca de cómo se debe llevar a cabo la actualización, en la que se advierte sobre lo que hay que hacer para que no ocurra el error que se te produce: https://docs.moodle.org/all/es/Actualización_de_moodle
Saludos.
JP