O Moodle não tem essa funcionalidade.
Talvez o melhor seja esconder a lista de disciplinas da página principal da plataforma. Desde modo, os utilizadores apenas verão as disciplinas em que estão inscritos.
Há ainda um parâmetro na administração do Moodle, que permite retirar o link Todas as disciplinas da navegação.
Note que, mesmo assim, a lista de todas as disciplinas não deixa de estar disponível se o utilizador conhecer o link. A alternativa é via Apache, inibir o acesso à pagina course/índex.php