Yo llevo también mucho tiempo buscándolo. Exactamente desde que importé todo un curso en otro cuando quería importar sólo un tema.
Y entonces no encontré nada y tuve que borrar una a una todas las actividades.
Hoy lo he vuelto a buscar y he encontrado un bloque llamado "Mass Action". Está un poco desactualizado (la última versión es para Moodle 3.4).
Yo lo he probado en mi Moodle 3.7.1+ y, salvo problemas con el idioma, me ha funcionado.
Permite ocultar, mostrar, borrar, mover y copiar todos los componentes de un tema (topic) o de todos. Yo he probado borrando un tema entero con 2 actividades y me ha funcionado. Luego he probado a borrar todo un curso con 145 actividades y me ha borrado todo. Sólo te deja los nombres de los temas con su descripción.
Ya me contaréis.