1. Temat 1 to nie jest raczej do dyskusji na forum ;)
2. W temacie 2 - Do tego ważna jest informacja, gdzie podmieniłeś pliki ikon? Prawidłowo powinno być to robione w katalogu szablonu.
Coś mi się wydaje, że masz hosting, gdzie system jest automatycznie aktualizowany. Wszystkie zmiany robione w niewłaściwych miejscach są nadpisywane przez pliki nowszej wersji Moodle.