есть куча продуктов, конвертирующих .pdf в html5 анимацию с оглавлением, поиском, закладками и.пр. и др.
по моему опыту самый качественный - FlippingBook. но есть масса поделок, очень похожих на него и давно взломанных
собирать такую анимацию обратно в .pdf - себе дороже