Hola!
Aporto el problema y la solución en este mismo post.
Problema: Tras crear marco de competencias de prueba, imposibilidad de borrarlo en Moodle 3.6 :-O
Solución: Acceder a CPanel (servidor compartido), abrir PHPMyAdmin, buscar mdlgk_competency_framework, abrir mdlgk_competency_framework, seleccionar marco de competencias y pulsar opción 'delete'.
Voilà! Problema solucionado!
Espero que os sea de utilidad
Salu2