Такое впечатление, что каждый сам с собой разговаривает
Очередность разбора *html файлов из архива при импорте глав в книгу определяется названиями самих файлов (или папок, если у вас каждая глава - отдельная папка, а не просто *html файл). Поэтому вам нужно перед импортом все файлы/папки пронумеровать в нужной последовательности, чтобы потом в Мудл у вас не было ситуации, «в которой надо 150 главу прогнать до 6, а потом 6 загнать к 120»
Т. е., структура импортируемых файлов должна быть такой:
Глава 1 - файл 001.html
Глава 2 - файл 002.html
......................................
Глава 150 - файл 150.html
Если у вас каждая глава лежит в отдельном каталоге, нумеруйте каталоги:
На заметку: оглавление формируется из содержимого тега <title> HTML-файла. Поэтому, чтобы не редактировать названия глав в Мудл, заполните/отредактируйте эти теги в HTML перед импортом.