Hola, Educantel.
Creo que te has quedado con el concepto de lo que eran los Agrupamientos en las versiones muy antiguas (1.x) de Moodle. En las versiones actuales, su principal función es otra, al menos desde mi punto de vista.
Imagina que tienes un curso con 20 alumnos y el curso tienes dos partes, fases o etapas bien diferenciadas (A y B). Al comienzo (fase A) quieres que los alumnos trabajen en grupos grandes, con lo que creas solo dos grupos: FA-1 y FA-2, cada uno con 10 alumnos.
En la otra parte (fase B) quieres que trabajen en grupos más pequeños, de 4 personas. Así creas los grupos FB-1, FB-2, FB-3, FB-4 y FB-5.
Por tanto, cada alumno pertenecerá a dos grupos: FA-1 ó FA-2, pero también a uno de los cinco FB-x
Si para cada fase quieres que tengan un Foro por grupos (separados o visibles), que funcione correctamente y no se haga un lío con los 7 grupos, lo adecuado sería crear un "Agrupamiento FA" (incluyendo a los dos grupos FA) y otro "Agrupamiento FB" (con los cinco grupos FB).
En la configuración del primer Foro FA tendrías que especificar que es para el "Agrupamiento FA" y en el segundo, que es para el "Agrupamiento FB". Con ello, los foros no dejan de ser visibles para nadie, sino que al entrar al mismo lo que se observa que hay 2 o 5 (en cada caso) grupos de discusión.
Por cierto, que con la configuración de roles estándar, creo que TODOS los profesores (con o sin permisos de edición) reciben en su correo copia de los mensajes de todos los grupos, sin importar que estén inscritos en un grupo u otro. Al menos así era en la versión 3.1 ... tengo que comprobarlo en la 3.5
Saludos.