Olá Reginaldo,
Sobre o uso do Moodle para cursos no "formato" Mooc, penso que é possível ter alguns parâmetros de configuração do site como todo por meio do recurso "presets" disponível a partir da versão 4.0. Isso poderia ser comparilhado entre usuários que são administradores.
Contudo, a dinâmica de funcionamento de cursos Mooc ocorre dentro de cada curso em si, portanto não consigo visualizar um "instalação" do Moodle com tais características pré-definidas.
Dentro dos cursos é provável o uso de configurações de Acompanhamento de conclusão, acesso restrito e provas online com correção automática (quiz), dentre outras ferramentas, contudo de acordo com cada curso e seus objetivos educacionais isso poderá variar em maior ou menor proporção.
Espero ter ajudado.