Bonjour Kévin,
Il est généralement préférable d'éviter de supprimer des lignes directement dans la base de données car de nombreux liens existent entre les différentes tables et la suppression d'une ligne dans la base de données peut parfois avoir des conséquence irréversibles.
Je proposait l'idée d'observer la base de données pour comprendre d'où venait le problème afin d'essayer de comprendre ce qu'il fallait supprimer sur Moodle pour pouvoir supprimer les compétences récalcitrantes.
Peut-être que Administration du site>Développement>Editeur XMLDB>Vérifier les clés extérieures permettra de mettre en évidence certains liens qui auraient été perdus par la suppression de ces deux lignes. Dans ce cas, cette commande propose une requête SQL à exécuter dans la base de données pour corriger les problèmes engendrés par les liens rompus avec ces compétences.