Hola Kenia.
Tienes varios temas (templates) que pueden funcionar para lo que requieres. Algunos temas como Moove permiten subir hojas de estilo personalizadas con lo cual tienes muchas opciones a la hora de cambiar la visualización del tema. Es otra opción y en realidad es de mis preferidas por la libertad que brinda.
Moove es un tema que está disponible para Moodle 3.2 y superiores, pero, para 3.1 existen otros que también lo permiten, por ejemplo envolve-D el cual utilicé para una implementación que hice para un cliente que solicitaba cambiar fondos, poner imágenes de cabecera y otras modificaciones las cuales solucioné con CSS desde la configuración del tema en la administración de Moodle sin necesidad de modificar los códigos en el servidor. Recuerdo que tiene también un campo de texto donde puedes colocar líneas de código que quieres que se inserten en <head> y otro para el final de <body>.
Feliz semana.