Bueno José lo que use para mostrar una secuencia Flash un enlace a partir de la paguina web.
te explico, primero creas la secuencia que desees que se vea en tu portal luego debes crear una pagina web donde se vea la secuencia por ejemplo esta:
<html>
<body>
<div align="center">
<object classid="clsid:D27CDB6E-AE6D-11cf-96B8-444553540000" codebase="http://download.macromedia.com/pub/shockwave/cabs/flash/swflash.cab#version=6,0,29,0" width="375" height="375">
<param name="movie" value="Película2.swf">
<param name=quality value=autolow>
<embed src="Película.swf" quality=autolow pluginspage="http://www.macromedia.com/shockwave/download/index.cgi?P1_Prod_Version=ShockwaveFlash" type="application/x-shockwave-flash" width="375" height="375"></embed>
</object>
</div>
</body>
</html>
Este codigo debe estar guardado en con un formato htm o html y solo debes cambiar el archivo "Película.swf"; ojo de bes poner la dirección correcta donde se encuentre en tu servidor.
En un segundo paso en el Moodle crea por ejemplo una etiqueta donde debes introducir el siguiente codigo en el modo editor:
<p align="center" /><p align="center"><iframe style="WIDTH: 400px; HEIGHT: 410px" src="http://www.Dirección.com/archivoHTM.htm" frameborder="0"></iframe>
con esto lograras que se pueda ver una secuencia flash o lo que quieras en realidad en un etiqueta.
Bueno en realidad no se si es mucho complicarse la vida pero a mi me dio resultado y de esta manera no corremos riesgo de modificar algo ....
ojala te haya sido de utilidad si no esta claro avisame y te dare mas detalles
saludos