Álef, ainda com esse problema?
Eu passei por isso quando ativei o fluxo de avaliação nas configurações da tarefa (Administração do site/Plugins/Atividades/Tarefa/Configurações da tarefa).
Quando ativo o fluxo de avaliação o professor deve publicar a nota. Em vários momentos os professores aqui davam a nota mas esqueciam de definir como publicada. Sem publicar a nota ela não constará no livro de notas.
O que fiz foi orientar os professores/tutores quanto ao uso da atividade. Mantive o "fluxo de avaliação"ativo pois ele permite que você vá avaliando os alunos mas libere as notas posteriormente em uma leva só.
Espero ter ajudado. Até logo,
Blaine