Hola Xiomara,
Hay documentación de esto en esta página https://docs.moodle.org/all/es/Subir_usuarios.
El archivo de csv debe tener una linea primera con los nombres de los campos (en inglés y de letras minúsculas), y hay cuatros campos obligatorios: username, firstname, lastname, email.
Por ejemplo, lo que quieres hacer es como así:
username,firstname,lastname,email,institution,city,country
jgarcia,Juana,Garcia,jgarcia@example.com,"Institución Grande","San José",CR
cfuentes,Carlos,Fuentes,cfuentes@example.com,"Institución Dos",Guadalajara,MX
Cuidado que el código de país debe ser el de ISO "alpha-2 codes" cuales tienen dos letras MAYÚSCULAS - https://docs.moodle.org/all/es/Subir_usuarios#Pa.C3.ADs. Por ejemplo, CR, MX, US son correctos.
Una lista de estos está aquí - https://en.wikipedia.org/wiki/ISO_3166-1_alpha-2#Current_codes.
También hay unos videos para mostrar el método de subir usuarios, por ejemplo -
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Al fin, te sugiero que lo compruebes al principio usando un archivo de csv pequeño (alrededor de 10 usuarios) el cual tiene solo cuentas de usuarios fingidos.
Saludos,
Randy