I file che carichi attraverso l'interfaccia di Moodle sono memorizzati secondo logiche interne, tra le altre cose utili anche ad ottimizzare significativamente lo spazio utilizzato.
Puoi approfondire il funzionamento nella documentazione:
Per quanto riguarda il backup, eseguendo il backup periodico dell'intero sito e stoccando ii backup su un sistema diverso da quello dove gira Moodle, avrai la possibilità di ripristinare il sito in toto ed in tempi ragionevoli:
Accertati naturalmente che il backup effettuato ripristini realmente il sito al suo status quo, effettuando delle prove.