Bonjour,
Effectivement, les groupements ne possèdent pas autant d'options que les groupes au sein du cours.
Ils sont utiles uniquement pour paramétrer une restriction d'accès aux activités, ressources ou sections d'un cours à un ou plusieurs groupements : https://docs.moodle.org/3x/fr/Groupements
Donc à priori, je ne vois pas d'autres solutions dans votre cas que de créer les groupes correspondants au TD/Amphi et de ventiler les étudiants manuellement, mais peut-être que d'autres membres de la communauté auront une meilleure idée.
Si toutefois vous optez pour cette solution, comme les inscriptions de votre cours semblent automatiques, vous pouvez mettre en place une surveillance d'événements dans votre cours sur l'action "Utilisateur inscrit dans un cours". Vous aurez ainsi une alerte à chaque étudiant nouvellement inscrit.
Voir la documentation associée : https://docs.moodle.org/3x/fr/Surveillance_d'%c3%a9v%c3%a9nements
Seb