wenn es eine zip-datei ist, dann muss diese ja entpackt werden. ich erinnere mich, dass das mal etwas länger dauern kann. vielleicht liegt das daran, dass es viele dateien mit unterverzeichnissen sind (auch wenn die datenmenge insgesamt gering ist). falls viele unterverzeichnisse vorhanden, könnte man auch nochmal probieren, wie sich das system verhält, wenn alle dateien in dem obersten verzeichnis liegen und keine unterverzeichnisse vorhanden sind.
(vielleicht ist ja auf dem system selbst ein virenscanner aktiv, der die datei prüft und dafür zeit benötigt.)
(man könnte sich auf dem server einloggen und die prozesse mal während dieses vorgangs anschauen - htop - )