Moodle journalise des événements concernant les actions des usagers... mais à mon avis, pas grand chose là dedans. Tout est stocké en base de données.
Mais peut-être parles-tu des logs Apache (ou autre application Web) qui délivre les contenus HTML/PHP ?
Là, ça dépend de ton hébergeur. Je lis que tu as un VPS donc j'imagine que tu as installé le service Web toi-même. Tu dois avoir un dossier /var/log par défaut et ensuite, tu dois trouver ton chemin vers le service web correspondant. Il y a beaucoup trop d'inconnues à notre niveau pour se risquer à répondre plus précisément, désolé.
A bientôt,
Patrick