José, hice lo que me dijiste y todo está en orden, los roles, el contexto, los permisos, y la base de datos está correcta. Pero te informo que ya pude resolver el error que tenía, en el archivo access.php no separe correctamente el array
$capabilities = array('mod/collaborative:addinstance' => array(...),
'mod/collaborative:view' => array(...),
'mod/collaborative:submit' => array(...), //me hacía falta esta coma.
'mod/collaborative:manage' => array(...)
);
Te agradezco por estar pendiente al problema que se me presentó, cualquier duda o avance que tenga te contacto. Muchas gracias, un saludo.