Lo primero indicarte que la instalación o actualización de moodle a través de cualquier auto-instalador es una mala practica y que suele llevara problemas en el futuro y NUNCA se debe utilizar. Si buscas en el foro veras bastante hilos sobre ese tema.
La versión de moodle la tienes en Administración del Sitio > Notificaciones. La captura es del aviso donde muestra a que versión has de actualizar pero no la versión actual.
En cuanto al proceso, simplemente es diferente al resto porque Moodle tiene particularidades que los demás no tienen. Tenemos tres apartados que actualizar (habitualmente son dos): database, moodledata y archivos. Has de realizar la copia de todos (aunque hay veces que no es necesario), actualizar y arrancar moodle para iniciar el procedimiento de actualización de la BBDD.
Realmente es muy simple y la diferencia es la indicada. Moodle es mucho más complejo que WP o Joomla y por tanto no puede tener el mismo procedimiento.