Hola Luciano, por favor podrías poner capturas de pantalla de cuáles son las opciones que te aparecen? Cuando instalaste Moodle te tuve que haber pedido un super usuario para tu sitio, puedes ingresar de esa forma para poder definir roles de administrador por el momento.
Sobre la automatriculación, una vez que hagas un curso puedes entrar a él y habilitar en
Ajustes del curso -> Usuarios -> Métodos de inscripición y habilitar Auto - Inscripción (Estudiante)
De esa manera los cursos que así definas los alumnos podrán entrar y matricularse solos a un curso.
Saludos.