Nella documentazione che ti ha suggerito Sergio sono elencati i passi necessari per la configurazione del repository. Forse hai saltato qualche passaggio, ad esempio potresti aver tralasciato la fase nella quale si devono creare a mano le sotto cartelle dove saranno caricati i file, oppure i permessi delle cartelle/file non sono corretti.

Prova a rivedere i passaggi e controlla i permessi sul filesystem.