Есть много нюансов. Если Вы не изменяете код moodle (то есть код всех тех файлов, которые вы скачали в дистрибутиве с сайта), то к Вам, по сути, нет никаких претензий. Используя систему вы соглашаетесь с требованием предоставить код другим, но по запросу. При этом, если у Вас запросят этот код, вы можете дать ссылку на moodle.org, где вы сами его и взяли.
Если вы добавляете в moodle плагины, то для каждого плагина отдельное лицензионное соглашение (хотя обычно такое же как и для moodle), поэтому если вы ставите плагины, но не изменяете их, тоже никаких претензий. Плагины ставятся отдельными файлами, поэтому не меняются файлы moodle.
Если вы напишите свой плагин, то можете регулировать вопросы его использования своей лицензией. Но эта лицензия будет распространяться только на сам плагин, а не на остальную систему, в составе которой он работает.
Лицензия относится к коду, поэтому она не накладывает никаких ограничений на контент, размещенный в системе, настройки и т.п. - это интеллектуальная собственность разработчиков контента, не имеющая отношения к самой системе moodle.
Теперь всё вместе. Вы поставили moodle, накачали плагинов, поставили нестандартную тему. Настроили всё это. Заполнили контентом. Moodle вы используете по лицензии, контент Ваш. Если у Вас запросят исходный код системы, вы можете дать ссылку на официальный сайт. Если у Вас запросят контент, например, вопросы тестов с ответами, вы никому ничего не должны давать. Теперь вы допилили какую-то тему, чтобы сайт выглядел как вам нужно. Если тема распространялась по GPL и вы изменили её код, то вам придется поделиться измененным вариантом с любы, кто попросит. Но обычно не просят )). А если вы создадите тему или любой плагин с нуля, то делиться не нужно.
Поэтому если вы кому-то оказываете услуги, связанные с созданием сайта на moodle, вы не можете продавать эту систему, поскольку она вам не принадлежит. Вы продавать оказывать услуги по установке и настройке системы, наполнению её контентом.