Los problemas que comentas son de moodle no del tema usado. El de calificaciones posiblemente se puede solucionar con un render nuevo pero el de el perfil es un problema del core y por tanto deben solucionarlo desde desarrollo. Este último no comprendo como no existe ya que otras paginas de configuración si que muestran el mensaje tras un cambio.
Te aconsejaría que abrieras una incidencia para cada una de ellas en Moodle Tracker y que lo comentaras en el foro de Usabilidad (no hay de Accesibilidad que yo recuerde) y asi podrás hacer algo más de presión para que hagan los cambios en una próxima versión.