Hola Juan Carlos,
ClamAV es un antivirus que trabaja en un entorno linux.
Por tanto, tu moodle debería estar alojado en un servidor con entorno linux para poder instalar ClamAV
ClamAV se instala en el servidor, como un programa más.
Aquí tienes un tutorial sobre la instalación en Ubuntu: http://www.solvetic.com/tutoriales/article/2784-como-instalar-y-usar-el-antivirus-clamav-en-ubuntu/
Una vez instalado debes habilitar la ruta en Moodle, desde el menú de administración.
Saludos
JP