Hola,
Primero, debes tener el módulo de Certificado activo, por tu pregunta asumo que así es.
Segundo, debes activar "Habilitar acceso restringido" para tu sitio, en:
Administración > Administración del sitio > Características avanzadas
después de ello, en las actividades y recursos aparece una sección de "Restringir acceso", con lo que puedes elegir bajo qué condiciones se verá, en este caso, la liga a tu certificado.
La condición puede ser por fecha, calificación de una evaluación, porcentaje completado, tiempo cursado, etc.