Найти то обсуждение мне не удалось. Но там все равно было только желание, а не решение.
Первоначально курс содержит единственную категорию, где собраны все оценки курса. Если вы создали дополнительные категории, но при создании нового задания не указали в какую категорию поместить оценку за это задание, то Moodle помещает ее вне этих категорий, где-то в конец журнала. И это нормально. А как же иначе? Как Moodle может угадать, в какой категории вы желаете видеть эту оценку? Если вас не устраивает то место, в которое Moodle ее поставил, то переместите ее куда хотите. В чем проблема?
Еще раз повторяю, что секции в курсе и категории в журнале никак не связаны. Например, секций в курсе может быть много, а категория в журнале - одна, а может быть наоборот - секция одна, а категорий много. Структуру категорий и принадлежность к ним оценок задаете вы.