¡Muchas gracias Eder!
La línea
$courses = enrol_get_my_courses();
la modifiqué por
$courses = enrol_get_my_courses(NULL, 'id DESC');
y funcionó como lo necesitaba.
Esperemos que en versiones posteriores esta opción se pueda modificar desde Moodle y no en el código.
Saludos cordiales.
Verónica.