Hola. Imagino que ya lo resolvieron, pero, si alguien tiene este problema puede leer la posible solución. Si en el servidor se tiene MariaDB esta debe ser seleccionada cuando el instalador de Moodle pregunta por el Servidor de bases de datos, por defecto muestra MySQL (nativo/mysqli) o MySQL mejorado (nativo/mysqli) en cuyo caso se debe seleccionar MariaDB (nativo/mariadb) y ya no mostrará el error en el resumen de instalación.
Espero sea de utilidad para alguien.