Hola
Particularmente prefiero trabajar con cursos diferenciados en ese tipo de entornos, pero entiendo que en muchos casos las necesidades son diversas. Por lo general un docente puede acceder a todos los grupos, pero en este caso no sería conveniente. Revisa los permisos de los docentes respecto del grupo, podría restringirlos sólo en algunas actividades y no en otras (como los foros, por ejemplo):
En esa misma página tienes muchas otras opciones de trabajo con grupos.
Un saludo