Hola Manuel:
Tengo una situación parecida a la tuya (Moodle 1.9.5 en producción y Moodle 2.8.8 en pruebas en localhost).
Me gustaría saber si has solucionado el tema y como. ¿Tienes actualmente en producción las dos versiones y cuales? ¿Puede decirme que versión de Apache, Php y MySql tienes actualmente corriendo en la versión 1.9 y en la 2.9?
Un saludo,