как сделать на сайте ЧПУ урлы
Пока никак, или прописывать самому в настройках веб-сервера RewriteCond и RewriteRule
Можно ещё посмотреть локальный плагин, но он требует редактирования оригинального файла /lib/weblib.php, и как работает - неизвестно.
На трекере есть MDL-28030 - можете поучаствовать.
Что касается метатегов, moodle формирует их сама, например, включая в тег meta описание сайта на главной странице (frontpage). Достаточно заглянуть в файл используемой темы frontpage.php: <meta name="description" content="<?php p(strip_tags(format_text($SITE->summary, FORMAT_HTML))) ?>
На других страницах сайта работает функция standard_head_html, тег meta содержит название страницы (<meta name="keywords" content="moodle, ' . $this->page->title . '" />)