Hola
Los grupos funcionan para que un profesor administre varios grupos de alumnos o para que existan varios grupos cada uno con un profesor. Un profesor puede ver varios grupos si se le inscribe a cada uno.
Si no quieres que se vean, tienes que elegir que son grupos separados. Luego, para el rol de profesor hay que quitar una capacidad que se llama moodle/site:accessallgroups .
Para quitarla debes tener rol de administrador y ir a la sección Administración del Sitio > Usuarios > Permisos > Definir Roles
Los agrupamientos son un conjunto de grupos y sirven para que ciertos grupos tengan acceso a determinadas actividades y que estas actividades sean solamente visibles para ellos.