En soi, vider la table mdl_log ne fera pas bugger la plate-forme mais vous perdrez tous les historiques de consultation. Certains modules peuvent s'en servir mais vous le verrez et ca ne sera pas bloquant. A l'installation de Moodle, cette table est à priori vide.
Mais effectivement la meilleure manière de procéder est de faire ce que conseillait Séverin.