Hola,
La documentación en español está en https://docs.moodle.org/all/es/Gestionando_insignias#Eliminar_insignias y, de leerla, al parecer si se puede "Eliminar y remover todas las insignias otorgadas existentes - si se
elige esta opción, entonces la insignia ya no estará disponible y los
estudiantes que la habían ganado previamente ya no la mostrarán en su
perfil."