Вы несколько ошибаетесь.
Главной причиной создания "мета-курсов" обозначено желание получить форумы, автоматически доступные ученикам нескольких курсов. Типа, комьюнити такие, по интересам. (Вот ветка дискуссии, в которой разработчик описывает "original rationale behind the development": http://moodle.org/mod/forum/discuss.php?d=17269#84553)
Интересный вариант использования, похожий на основной - но с несколько более конкретно обозначенной (неожиданной, на мой взгляд) особенностью назначения - делать для ряда курсов, имеющих общий технический инструментарий, специальный метакурс про тех-поддержку этого инструментария.
Вариант, который Вы описали как основной - сделать рабочие курсы "мета-курсми", и зачислять на них людей пачками, заранее сгруппировав их в "классы" с помошью курсов, которые "не мета" и вообще скрытые - тоже весьма интересен, но согласитесь, кривоват. Хотя, за неимением лучшего - тоже может быть весьма применим.
Общий форум
Мета-курсы...
На этом форуме установлен лимит сообщений, которые Вы можете создать за заданный период времени - в настоящий момент количество сообщений - 2 за 1 день