Hola Alejandro,
Si te refieres a la ventana que aparece a la derecha del árbol de contenidos, suele ocurrir con el navegador Chrome y para el primero de los SCOs. Se soluciona efectivamente moviendo el zoom, aunque obviamente no es la solución deseable. Se trata de un bug del Chrome que parece que se corregirá en próximas versiones, de hecho, ya se ve correctamente en la versión beta de Google Chrome Canary, que si se instal·la, funciona paral·lelamente con la versión estándard de Chrome.
Este error está reportado en el Moodle Tracker (https://tracker.moodle.org/browse/MDL-48375), donde también se da una solución provisional modificando el CSS (https://moodle.org/mod/forum/discuss.php?d=277360#p1193793).
El problema ocurre tanto si se visualiza el SCORM incrustado como en una ventana aparte, así que lo que sugiere la compañera Farina Cárdenas afectaría a la ventana general pero no a la de la derecha del árbol de contenidos que es la que se visualiza incorrectamente.
Mientras tanto, habrá que esperar o utilizar otros navegadores.