Gracias Álvaro y Ricardo por vuestras respuestas.
Encontré la solución y espero que sea útil para alguien:
Había subido la carpeta moodledata desde el filezilla con la opción de transferencia puesta a ASCII. La borré e hice una copia directamente desde el Adm. de ficheros del CPanel y ahora están visibles los recursos de ficheros e imágenes.
No probé de volver a subir la carpeta por Filezilla con opción de transferencia en BIN, pero creo que también funcionaría.
Por lo que vi en los foros hay muchas causas posibles, aquí hay un post que me orientó:
moodle.org/mod/forum/discuss.php?d=261009
Saludos
Leonora