I file vengono memorizzati nella cartella "moodledata", in particolare se utilizzi Moodle 2.x nella cartella "moodledata/filedir". Anche i backup dei corsi, a meno di configurazioni che puoi aver impostato, in Moodle 2.x vengono memorizzati nelle cartella "moodledata/filedir".
Tuttavia, prima di accedere direttamente nella cartella "moodledata/filedir", è bene approfondire come Moodle 2.x memorizzi i file ed evitare di modificare il contenuto nella cartella "filedir" a meno che non si sappia molto bene come operare: