Per quanto riguarda l'aggiornamento di Moodle trovi delle istruzioni nella documentazione:
Prima di aggiornare penso sia comunque preferibile che tu risolva le problematiche di visualizzazione che hai incontrato, se sono dovute a codice inserito nelle etichette non penso che l'aggiornamento di per se possa risolverle.
Circa l'approfondimento di Moodle, ti segnalo questa discussione dove tra gli altri vengono proposti link a tutorial e documentazione: