Hola,
No dices si lo ocultaste sólo de la página principal o del sitio entero.
Prueba a logarte como administrador y una vez logado prueba a poner lo siguiente en la barra de navegación:
http://tu.sitio/course/category.php?id=1
Debería llevarte a la lista de categorías. Quizá allí puedas ver el bloque de ajustes. O, tal vez puedas habilitar la "edición" por alguna parte.
Si consigues habilitar la edición, te vas a la página principal (con la edición habilitada).
Deberías entonces poder ver el bloque "agregar un bloque" con su menú desplegable para añadir el bloque ajustes que te falta en ese lugar.
Otra opción sería que si está visible el bloque ajustes en la página de lista de cursos o categorías, pudieras editar el bloque ajustes para que sea visible en toda la plataforma, o en "cualquier página".
Algo así...
Espero te sirva de algo. Y suerte...
JP