Конвертер преобразует текст в html путём копирования его в отдельный документ и сохраняя там в html. Возможно сбились настройки сохранения в html - попробуйте сохранить любой документ в формате веб-страница с фильтром, возможно будет окно с настройкой кодировки, или что-то подобное.
Возможно у вас стоит какая-то программа следящая за буфером обмена, например puntoSwitcher, попробуйте удалить все такие программы