Hola. ¿Configuraste el correo por SMTP? Si lo haces así todos los correos salen de la cuenta del administrador (la configurada por SMTP). Normalmente dejar la configuración del correo por PHP funciona de forma adecuada, salvo problemas con el dominio o servidor.
Para reducir el número de correos que reciben los profesores deben configurar las tareas y su perfil de forma adecuada para que no suceda.
Un saludo. Roberto